《一念关山》的故事设定在虚构的梧国与安国之间，朱衣卫前左使任如意假死后潜入梧都，结识六道堂副堂主宁远舟。宁远舟为证明同僚清白，重回六道堂，召集于十三、元禄、钱昭等人，护送女扮男装的公主杨盈出使安国。任如意为查昭节皇后（王艳饰）之死真相，与小分队同行。一路上，他们历经梧都暗杀、关山劫杀、安都内乱，最终揭开安国皇帝（尹铸胜饰）与李同光的篡位阴谋。
在大结局（第40集）中：
- 终极对决：小分队在安都与李同光对峙。宁远舟身中数刀仍坚持作战，任如意以一敌众刺杀敌将。杨盈揭露身份，联合元禄、钱昭智取敌方粮草，李同光兵败自杀。
- 牺牲与告别：宁远舟为掩护任如意身负重伤，在胜利后倒在任如意怀中，留下遗言：“如意，活下去。”他死后，任如意悲痛欲绝。
- 天下初定：杨盈登基为梧国女帝，推行新政，小分队其他成员各奔前程。任如意孤身返回关山，隐居山林。
- 结尾画面：镜头定格在任如意身着红衣，站在关山之巅，手持宁远舟的佩剑，凝视远方。背景是风雪漫天的壮丽山河，配以片尾曲《关山》（刘宇宁演唱），悲壮中透着释然。
结局带来的思考
- 牺牲与救赎的代价
- 宁远舟的死与任如意的独活，让人反思：为家国大义牺牲挚爱是否值得？救赎他人是否必须以失去自我为代价？
- 侠义精神的延续
- 小分队虽四散，但杨盈新政象征希望，启发思考：在乱世中，侠义是否能通过下一代延续？
- 个人与家国的抉择
- 任如意放弃权力选择隐居，宁远舟为国捐躯，令人思索：在个人幸福与国家责任间，如何找到平衡？
- 女性力量的觉醒
- 任如意与杨盈从被动到主动的成长，反思：在男权主导的江湖与朝堂，女性如何以智慧与武力书写传奇？